作为大赛的主办单位之一，上海科普教育发展基金会不仅积极支持上海市青少年科技创新大赛，同时，为了培养青少年和科技辅导员的创新精神和实践能力，连续多年出资设立“赛复青少年科技创新奖”、“赛复优秀科技教师奖”专项奖。经网上初评和现场审核，每年评选出“赛复优秀科技教师奖”5个，“赛复青少年科技创新奖”10个优秀项目。